Dnaman是一款生物應(yīng)用軟件,可以幫助從事生物學(xué)方面的朋友,這里分析核酸、蛋白質(zhì)等內(nèi)容,日常工作都可以在線使用,免費開源,大家隨時安裝哦!
Dnaman特色
1、DNA和蛋白質(zhì)序列編輯。
2、DNA序列轉(zhuǎn)化。
3、多序列比對,對齊編輯和分析。
4、系統(tǒng)樹分析。
5、DNA或蛋白質(zhì)序列的點陣比較。
6、DNA序列組裝和編輯。
7、BLAST通過網(wǎng)絡(luò)界面在Intranet / Internet Server上進(jìn)行搜索。
8、序列和數(shù)據(jù)庫中的增強(qiáng)型圖案搜索。
9、SiRNA選擇器。
10、限制分析。
Dnaman亮點
繪制序列圖與出版品質(zhì)。
限制模式預(yù)測。
電子克隆。
從限制片段重建限制圖。
靜音突變分析創(chuàng)建/破壞限制性位點。
導(dǎo)向不匹配以創(chuàng)建/破壞限制站點。
翻譯和密碼子使用分析。
蛋白質(zhì)疏水性/親水性分析。
蛋白質(zhì)表征:等電點的序列組成和預(yù)測。
Dnaman功能
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測。
反向翻譯。
PCR和測序引物的設(shè)計。
表征DNA或引物序列的熱力學(xué)性質(zhì)。
分歧分析。
管理寡核苷酸,DNA和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫。
生成隨機(jī)序列。
Dnaman說明
1、數(shù)據(jù)庫管理
選擇數(shù)據(jù)庫|經(jīng)理命令打開數(shù)據(jù)庫管理器”對話框。
2、DNA和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫
該軟件的數(shù)據(jù)庫功能,允許用戶組織DNA和蛋白質(zhì)序列的不同科目。
3、編輯記錄信息
有關(guān)特定記錄的信息可以編輯。在序列列表框中,所有記錄按字母順序或記錄順序列出。每個記錄名字的數(shù)量顯示記錄的記錄號ID.用DNAMAN自動分配。因此,您可以為不同的記錄使用相同的名稱。
4、掃描序列的相似性
它掃描所有的序列記錄在默認(rèn)的數(shù)據(jù)庫搜索當(dāng)前序列的同源序列。如果默認(rèn)數(shù)據(jù)庫包含DNA序列,則默認(rèn)序列必須是DNA序列。如果默認(rèn)數(shù)據(jù)庫包含蛋白質(zhì)序列,則默認(rèn)序列必須是蛋白質(zhì)序列。DNAMAN將使用快速對準(zhǔn)方法掃描數(shù)據(jù)庫的序列相似性。您可以選擇對結(jié)果的最終輸出使用快速對齊或最佳對齊方式。
5、錯配分析
錯配分析的目的是找到所有可能的退火位點的DNA序列的引物在默認(rèn)。此功能可用于PCR和DNA測序的引物選擇。權(quán)重矩陣用來區(qū)分引物位置的重要性。由于引物在3’末端對目標(biāo)DNA的匹配比PCR擴(kuò)增的5末端更重要,所以更多的權(quán)重被賦予3’末端。為了提高PCR引物的特異性,應(yīng)始終檢查引物與靶DNA之間是否存在次級退火位點。
Dnaman測評
Dnaman是高度集成化的應(yīng)用!



































